2006年 移籍・FA・契約
2006年3月〜2007年2月のNPB公示から。FA有資格者 72人（うち今季取得22人）・FA宣言 8人（移籍3人・残留4人・海外1人）・自由契約 124人・トレード 27人・任意引退 22人・新規入団 8人・ポスティング 7人・FA人的補償 2人・支配下登録 2人。
FA宣言選手（8人）
| 選手 | 守備 | 区分 | 所属 | 行き先 | 合意日 | 今季成績 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 金本 知憲 | 外野手 | FA | 阪神 | 残留 | 2006-11-08 | 146試合 打率.303 26本 98打点 2盗塁 |
| 小久保 裕紀 | 内野手 | FA | 巨人 | ソフトバンクへ移籍 | 2006-11-20 | 88試合 打率.256 19本 55打点 1盗塁 |
| 門倉 健 | 投手 | FA | 横浜ベイスターズ | 巨人へ移籍 | 2006-12-12 | 28登板 10勝9敗 154.1回 防御率4.84 |
| 小笠原 道大 | 内野手 | FA | 日本ハム | 巨人へ移籍 | 2006-12-12 | 135試合 打率.312 32本 100打点 4盗塁 |
| 岡島 秀樹 | 投手 | FA | 日本ハム | MLB/ボストン・レッドソックス | - | 55登板 2勝2敗 4S 20H 防御率2.14 |
| 塩崎 真 | 内野手 | FA | オリックス | 残留 | 2007-01-19 | 128試合 打率.278 9本 31打点 1盗塁 |
| 的山 哲也 | 捕手 | FA | オリックス | 残留 | 2006-11-08 | 49試合 打率.258 2本 6打点 3盗塁 |
| 日高 剛 | 捕手 | FA | オリックス | 残留 | 2007-01-26 | 115試合 打率.240 1本 29打点 3盗塁 |
FA有資格者（72人）
| 選手 | 所属 | 区分 | 今季取得 | 年齢 | 今季成績 |
|---|---|---|---|---|---|
| 今岡 誠 | 阪神 | FA | ○ | 32 | 59試合 打率.221 7本 29打点 1盗塁 |
| 片岡 篤史 | 阪神 | FA | ○ | 37 | 50試合 打率.165 1本 7打点 0盗塁 |
| 金本 知憲 | 阪神 | FA | ○ | 38 | 146試合 打率.303 26本 98打点 2盗塁 |
| 桧山 進次郎 | 阪神 | FA | ○ | 37 | 85試合 打率.180 2本 12打点 1盗塁 |
| 町田 公二郎 | 阪神 | FA | 37 | 14試合 打率.250 1本 2打点 0盗塁 | |
| 大西 崇之 | 巨人 | FA | ○ | 35 | 20試合 打率.133 0本 0打点 0盗塁 |
| 小坂 誠 | 巨人 | FA | ○ | 33 | 92試合 打率.183 0本 12打点 4盗塁 |
| 小久保 裕紀 | 巨人 | FA | 35 | 88試合 打率.256 19本 55打点 1盗塁 | |
| 前田 幸長 | 巨人 | FA | 36 | 28登板 0勝0敗 2H 防御率7.23 | |
| 木村 拓也 | 巨人 | FA | 34 | 62試合 打率.260 0本 7打点 0盗塁 | |
| 工藤 公康 | 巨人 | FA | 43 | 13登板 3勝2敗 70回 防御率4.50 | |
| 門倉 健 | 横浜 | FA | ○ | 33 | 28登板 10勝9敗 154.1回 防御率4.84 |
| 鈴木 尚典 | 横浜 | FA | ○ | 34 | 61試合 打率.329 2本 13打点 0盗塁 |
| 種田 仁 | 横浜 | FA | 35 | 80試合 打率.217 1本 17打点 3盗塁 | |
| 佐伯 貴弘 | 横浜 | FA | 36 | 86試合 打率.225 5本 37打点 1盗塁 | |
| 石井 琢朗 | 横浜 | FA | 36 | 146試合 打率.288 6本 32打点 12盗塁 | |
| 万永 貴司 | 横浜 | FA | 34 | 2試合 打率.000 0本 0打点 0盗塁 | |
| 黒田 博樹 | 広島 | FA | ○ | 32 | 26登板 13勝6敗 1S 防御率1.85 |
| 緒方 孝市 | 広島 | FA | 38 | 81試合 打率.284 6本 29打点 2盗塁 | |
| 高橋 建 | 広島 | FA | 37 | 54登板 2勝3敗 15H 防御率4.70 | |
| 前田 智徳 | 広島 | FA | 35 | 134試合 打率.314 23本 75打点 2盗塁 | |
| 浅井 樹 | 広島 | FA | 35 | 43試合 打率.222 0本 4打点 2盗塁 | |
| 佐々岡 真司 | 広島 | FA | 39 | 27登板 8勝8敗 149.2回 防御率4.09 | |
| 石井 一久 | ヤクルト | FA | ○ | 33 | 28登板 11勝7敗 177.2回 防御率3.44 |
| 古田 敦也 | ヤクルト | FA | 41 | 36試合 打率.244 0本 8打点 0盗塁 | |
| 土橋 勝征 | ヤクルト | FA | 38 | 29試合 打率.160 0本 3打点 0盗塁 | |
| 山部 太 | ヤクルト | FA | 36 | 1登板 0勝0敗 1H 防御率0.00 | |
| 宮本 慎也 | ヤクルト | FA | 36 | 73試合 打率.304 2本 34打点 3盗塁 | |
| デニー友利 | 中日 | FA | ○ | 39 | 31登板 0勝1敗 8H 防御率3.10 |
| 川相 昌弘 | 中日 | FA | 42 | 51試合 打率.273 0本 1打点 0盗塁 | |
| 落合 英二 | 中日 | FA | 37 | 5登板 0勝0敗 4.1回 防御率8.31 | |
| 上田 佳範 | 中日 | FA | 33 | 59試合 打率.222 0本 8打点 0盗塁 | |
| 山本昌 | 中日 | FA | 41 | 27登板 11勝7敗 1S 防御率3.32 | |
| 井上 一樹 | 中日 | FA | 35 | 108試合 打率.311 11本 39打点 2盗塁 | |
| 立浪 和義 | 中日 | FA | 37 | 113試合 打率.263 1本 31打点 3盗塁 | |
| 柴原 洋 | ソフトバンク | FA | ○ | 32 | 121試合 打率.277 3本 48打点 6盗塁 |
| 大道 典嘉 | ソフトバンク | FA | 37 | 44試合 打率.217 0本 8打点 0盗塁 | |
| 井出 竜也 | ソフトバンク | FA | 35 | 一軍出場なし | |
| 吉田 修司 | ソフトバンク | FA | 40 | 8登板 0勝1敗 2H 防御率12.00 | |
| 鳥越 裕介 | ソフトバンク | FA | 35 | 34試合 打率.243 0本 0打点 0盗塁 | |
| 高木 浩之 | 西武 | FA | 34 | 69試合 打率.288 0本 7打点 1盗塁 | |
| 西口 文也 | 西武 | FA | 34 | 26登板 9勝9敗 177.1回 防御率3.55 | |
| 石井 貴 | 西武 | FA | 35 | 46登板 4勝1敗 23H 防御率3.49 | |
| 江藤 智 | 西武 | FA | 36 | 52試合 打率.242 5本 19打点 1盗塁 | |
| 小笠原 道大 | 日本ハム | FA | ○ | 33 | 135試合 打率.312 32本 100打点 4盗塁 |
| 岡島 秀樹 | 日本ハム | FA | ○ | 31 | 55登板 2勝2敗 4S 20H 防御率2.14 |
| 田中 幸雄 | 日本ハム | FA | 39 | 58試合 打率.174 0本 4打点 1盗塁 | |
| 金子 誠 | 日本ハム | FA | 31 | 126試合 打率.254 6本 40打点 7盗塁 | |
| 中嶋 聡 | 日本ハム | FA | 38 | 79試合 打率.207 0本 5打点 0盗塁 | |
| 塩崎 真 | オリックス | FA | ○ | 33 | 128試合 打率.278 9本 31打点 1盗塁 |
| 日高 剛 | オリックス | FA | ○ | 29 | 115試合 打率.240 1本 29打点 3盗塁 |
| 清原 和博 | オリックス | FA | 39 | 67試合 打率.222 11本 36打点 0盗塁 | |
| 水口 栄二 | オリックス | FA | 38 | 91試合 打率.255 3本 24打点 0盗塁 | |
| 谷 佳知 | オリックス | FA | 34 | 118試合 打率.267 6本 30打点 1盗塁 | |
| 的山 哲也 | オリックス | FA | 36 | 49試合 打率.258 2本 6打点 3盗塁 | |
| 吉原 孝介 | オリックス | FA | 38 | 一軍出場なし | |
| 福浦 和也 | ロッテ | FA | ○ | 31 | 114試合 打率.312 4本 52打点 0盗塁 |
| サブロー | ロッテ | FA | ○ | 30 | 115試合 打率.218 9本 38打点 6盗塁 |
| 諸積 兼司 | ロッテ | FA | 37 | 20試合 打率.500 0本 2打点 0盗塁 | |
| 垣内 哲也 | ロッテ | FA | 36 | 5試合 打率.167 1本 3打点 0盗塁 | |
| 堀 幸一 | ロッテ | FA | 37 | 87試合 打率.227 6本 23打点 1盗塁 | |
| 井上 純 | ロッテ | FA | 36 | 30試合 打率.218 0本 1打点 0盗塁 | |
| 小倉 恒 | 楽天 | FA | ○ | 36 | 58登板 6勝7敗 4S 15H 防御率2.18 |
| 吉岡 雄二 | 楽天 | FA | ○ | 35 | 49試合 打率.240 0本 6打点 0盗塁 |
| 礒部 公一 | 楽天 | FA | ○ | 33 | 96試合 打率.275 4本 36打点 5盗塁 |
| 山崎 武司 | 楽天 | FA | ○ | 38 | 122試合 打率.241 19本 67打点 0盗塁 |
| 吉田 豊彦 | 楽天 | FA | 40 | 41登板 1勝1敗 1S 10H 防御率3.19 | |
| 飯田 哲也 | 楽天 | FA | 38 | 40試合 打率.273 1本 9打点 2盗塁 | |
| 関川 浩一 | 楽天 | FA | 38 | 81試合 打率.286 1本 9打点 7盗塁 | |
| 河本 育之 | 楽天 | FA | 39 | 40登板 2勝2敗 12H 防御率4.88 | |
| 酒井 忠晴 | 楽天 | FA | 36 | 7試合 打率.000 0本 0打点 0盗塁 | |
| 金田 政彦 | 楽天 | FA | 37 | 2登板 0勝2敗 8回 防御率6.75 |
移籍・契約（198件）
| 公示日 | 種別 | 選手 | 球団 | 備考 |
|---|---|---|---|---|
| 2007-01-25 | 自由契約 | 松沼 雅之 | ||
| 2007-01-19 | ポスティング | 前川 勝彦 | オリックス | 契約保留権放棄 |
| 2007-01-17 | ポスティング | 中村 紀洋 | オリックス | 契約保留権放棄 |
| 2007-01-16 | FA人的補償 | 工藤 公康 | 巨人 → 横浜 | FA移籍に基づく補償による |
| 2007-01-09 | ポスティング | 井川 慶 | 阪神 → MLB/ニューヨーク・ヤンキース | |
| 2006-12-25 | 自由契約 | 初芝 清 | ||
| 2006-12-25 | ポスティング | J・グラボースキー | オリックス | 契約保留権放棄 |
| 2006-12-25 | ポスティング | L・マルティネス | 中日 | 契約保留権放棄 |
| 2006-12-22 | ポスティング | 岩村 明憲 | ヤクルト → MLB/タンパベイ・デビルレイズ | |
| 2006-12-20 | ポスティング | 松坂 大輔 | 西武ライオンズ → MLB/ボストン・レッドソックス | |
| 2006-12-19 | トレード | 寺原 隼人 | ソフトバンク → 横浜 | |
| 2006-12-19 | トレード | 多村 仁 | 横浜 → ソフトバンク | |
| 2006-12-19 | FA人的補償 | 吉武 真太郎 | ソフトバンク → 巨人 | FA移籍に基づく補償による |
| 2006-12-12 | 育成契約の解除 | 呉 猛 | 巨人 | |
| 2006-12-11 | トレード | 戸部 浩 | ロッテ → 楽天 | |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 宮本 大輔 | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 吉原 孝介 | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 小島 昌也 | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 柴田 誠也 | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | W・オバミュラー | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 三木 仁 | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 小川 裕介 | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 野村 宏之 | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 中本 和希 | オリックス | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 天野 浩一 | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | J・ベイル | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 苫米地 鉄人 | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | J・フェリシアーノ | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 玉山 健太 | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 浅井 樹 | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 福井 敬治 | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 飯田 宏行 | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 鈴衛 佑規 | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | M・ロマノ | 広島 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | チェン | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 奈良原 浩 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 櫻井 嘉実 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 柳沢 裕一 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 川相 昌弘 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 高橋 光信 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 鳥谷部 健一 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 遠藤 政隆 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 落合 英二 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 川岸 強 | 中日 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 森 大輔 | 横浜ベイスターズ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 村西 哲幸 | 横浜ベイスターズ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 田中 一徳 | 横浜ベイスターズ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 矢野 英司 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 佐竹 学 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 酒井 忠晴 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 玉木 重雄 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | カツノリ | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 佐藤 和宏 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 戸叶 尚 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 金田 政彦 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | R・グリン | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 永池 恭男 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 飯田 哲也 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 益田 大介 | 楽天 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | F・セギノール | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 坪井 智哉 | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | B・トーマス | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 任意引退 | SHINJO | 日本ハム | |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 矢野 諭 | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 横山 道哉 | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 森 章剛 | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 吉崎 勝 | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 井場 友和 | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 岩下 修壱 | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 佐々木 貴賀 | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | C・リー | 日本ハム | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 佐藤 弘祐 | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 山本 光将 | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 原 俊介 | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 伊達 昌司 | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 十川 雄二 | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | G・グローバー | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 桑田 真澄 | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 大須賀 允 | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 南 和彰 | 巨人 | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | J・カブレラ | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 吉田 修司 | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 定岡 卓摩 | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | D・J・カラスコ | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 榎本 敏孝 | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | J・ズレータ | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 岡本 劼能 | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 芝草 宇宙 | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 北野 良栄 | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 宮地 克彦 | ソフトバンク | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 田崎 昌弘 | 西武ライオンズ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 小野 剛 | 西武ライオンズ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 宮崎 一彰 | 西武ライオンズ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 張 誌家 | 西武ライオンズ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 高波 文一 | 西武ライオンズ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 喜多 隆志 | ロッテ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 垣内 哲也 | ロッテ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 杉原 洋 | ロッテ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 瑞季 | ロッテ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 井上 純 | ロッテ | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 三澤 興一 | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | R・ガトームソン | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 平本 学 | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 本間 忠 | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 松谷 秀幸 | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 高橋 敏郎 | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 内田 和也 | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 久保田 智 | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | G・ラロッカ | ヤクルト | 保留されない選手 |
| 2006-12-01 | 自由契約 | 石橋 尚到 | 阪神 | 保留されない選手 |
| 2006-11-28 | 任意引退 | 万永 貴司 | 横浜ベイスターズ | |
| 2006-11-28 | 任意引退 | 福本 誠 | 横浜ベイスターズ | |
| 2006-11-28 | 自由契約 | V・パスクチ | ロッテ | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-28 | 自由契約 | M・フランコ | ロッテ | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-28 | 自由契約 | K・バーン | ロッテ | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-27 | トレード | 辻 俊哉 | ロッテ → オリックス | |
| 2006-11-27 | トレード | 早川 大輔 | オリックス → ロッテ | |
| 2006-11-27 | 任意引退 | 後藤 光貴 | 西武ライオンズ | |
| 2006-11-24 | 任意引退 | 土橋 勝征 | ヤクルト | |
| 2006-11-24 | 任意引退 | 細見 直樹 | ヤクルト | |
| 2006-11-24 | 任意引退 | 山部 太 | ヤクルト | |
| 2006-11-24 | 任意引退 | 片岡 篤史 | 阪神 | |
| 2006-11-24 | 任意引退 | 中林 佑輔 | 阪神 | |
| 2006-11-24 | 任意引退 | 町田 公二郎 | 阪神 | |
| 2006-11-21 | 自由契約 | 長谷川 尚生 | ||
| 2006-11-15 | 自由契約 | S・ソニア | 横浜ベイスターズ | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-14 | 自由契約 | K・ガルシア | オリックス | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-13 | 自由契約 | 吉田 幸央 | ||
| 2006-11-13 | 自由契約 | アレックス | 中日 | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-13 | 任意引退 | 萱島 大介 | 阪神 | |
| 2006-11-13 | 任意引退 | 筒井 壮 | 阪神 | |
| 2006-11-10 | トレード | 鴨志田 貴司 | 巨人 → オリックス | |
| 2006-11-10 | トレード | 谷 佳知 | オリックス → 巨人 | |
| 2006-11-09 | トレード | 仁志 敏久 | 巨人 → 横浜 | |
| 2006-11-09 | トレード | 小田嶋 正邦 | 横浜 → 巨人 | |
| 2006-11-08 | 自由契約 | G・アリアス | 巨人 | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-08 | 自由契約 | J・ディロン | 巨人 | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-07 | 任意引退 | 諸積 兼司 | ロッテ | |
| 2006-11-06 | 自由契約 | J・マシーアス | 日本ハム | ウエイバー不請求 |
| 2006-11-06 | 任意引退 | 鳥越 裕介 | ソフトバンク | |
| 2006-11-06 | 任意引退 | 井出 竜也 | ソフトバンク | |
| 2006-10-31 | 育成契約の解除 | 平岡 政樹 | 巨人 | |
| 2006-10-31 | 育成契約の解除 | 横川 雄介 | 巨人 | |
| 2006-10-31 | 育成契約の解除 | 崔 暁 | 巨人 | |
| 2006-10-31 | 育成契約の解除 | 安 旭 | 巨人 | |
| 2006-10-30 | トレード | 佐藤 宏志 | 巨人 → 楽天 | |
| 2006-10-27 | 自由契約 | C・オクスプリング | 阪神 | ウエイバー不請求 |
| 2006-10-23 | 自由契約 | C・ブランボー | オリックス | ウエイバー不請求 |
| 2006-10-23 | 任意引退 | 大西 崇之 | 巨人 | |
| 2006-10-23 | 任意引退 | 堀田 一郎 | 巨人 | |
| 2006-10-20 | トレード | 大道 典嘉 | ソフトバンク → 巨人 | |
| 2006-10-18 | トレード | 黒田 哲史 | 巨人 → 西武 | |
| 2006-10-13 | 任意引退 | 根市 寛貴 | 楽天 | |
| 2006-10-06 | 自由契約 | 渡辺 弘基 | ||
| 2006-10-05 | 自由契約 | C・バワーズ | 楽天 | ウエイバー不請求 |
| 2006-10-05 | 任意引退 | 杉山 春樹 | 西武ライオンズ | |
| 2006-10-05 | 任意引退 | 椎木 匠 | 西武ライオンズ | |
| 2006-10-05 | 任意引退 | 林 孝哉 | ロッテ | |
| 2006-10-05 | 自由契約 | J・ミラー | ロッテ | ウエイバー不請求 |
| 2006-10-05 | 任意引退 | 寺本 四郎 | ロッテ | |
| 2006-09-29 | 自由契約 | F・ディアス | 日本ハム | ウエイバー不請求 |
| 2006-09-28 | 自由契約 | J・ベバリン | 横浜ベイスターズ | ウエイバー不請求 |
| 2006-09-27 | 自由契約 | E・バレント | 楽天 | ウエイバー不請求 |
| 2006-08-21 | 自由契約 | ドミンゴ | 中日 | ウエイバー不請求 |
| 2006-08-21 | 自由契約 | C・ガルバ | 中日 | ウエイバー不請求 |
| 2006-08-15 | 自由契約 | 定岡 正二 | ||
| 2006-08-14 | 育成契約の解除 | E・ペレイラ | 中日 | |
| 2006-08-01 | 自由契約 | 川藤 竜之輔 | ||
| 2006-07-31 | 自由契約 | 乗替 寿好 | ||
| 2006-06-29 | 新規入団 | G・アリアス | 巨人 | |
| 2006-06-22 | トレード | 坂 克彦 | 楽天 → 阪神 | |
| 2006-06-22 | トレード | 牧野 塁 | 阪神 → 楽天 | |
| 2006-06-19 | トレード | 奈良原 浩 | 日本ハム → 中日 | |
| 2006-06-06 | トレード | 木村 拓也 | 広島 → 巨人 | |
| 2006-06-06 | トレード | 山田 真介 | 巨人 → 広島 | |
| 2006-05-26 | 新規入団 | E・バレント | 楽天 | |
| 2006-05-25 | トレード | 新里 賢 | 楽天 → ロッテ | |
| 2006-05-25 | トレード | 川井 貴志 | ロッテ → 楽天 | |
| 2006-05-24 | 支配下登録 | 小斉 祐輔 | ソフトバンク | 育成選手から移行 |
| 2006-05-24 | 支配下登録 | 西山 道隆 | ソフトバンク | 育成選手から移行 |
| 2006-05-24 | 新規入団 | M・ワトソン | ロッテ | |
| 2006-05-23 | 自由契約 | 佐伯 和司 | ||
| 2006-05-08 | トレード | 斉藤 秀光 | 楽天 → ソフトバンク | |
| 2006-05-08 | トレード | 松本 輝 | ソフトバンク → 楽天 | |
| 2006-05-08 | 新規入団 | J・ミラー | ロッテ | |
| 2006-04-28 | トレード | 龍太郎 | 横浜 → ロッテ | |
| 2006-04-28 | トレード | 山北 茂利 | ロッテ → 横浜 | |
| 2006-04-27 | 自由契約 | 松下 立美 | ||
| 2006-04-25 | 新規入団 | W・オバミュラー | オリックス | |
| 2006-04-25 | 新規入団 | R・グリン | 楽天 | |
| 2006-04-17 | 新規入団 | 小関 竜也 | 巨人 | |
| 2006-03-30 | 新規入団 | S・ソニア | 横浜ベイスターズ | |
| 2006-03-27 | トレード | 實松 一成 | 日本ハム → 巨人 | |
| 2006-03-27 | トレード | 岡島 秀樹 | 巨人 → 日本ハム | |
| 2006-03-24 | トレード | 青木 勇人 | 西武 → 広島 | |
| 2006-03-24 | トレード | 福地 寿樹 | 広島 → 西武 | |
| 2006-03-09 | 自由契約 | 安仁屋 宗八 | ||
| 2006-03-09 | 自由契約 | 三輪 悟 |